知网查重是指利用知网平台提供的查重服务进行文献查重，主要应用于学术论文、期刊等文献的查重工作。用户将待查重的文献上传至知网平台，系统会进行比对分析，给出查重结果和重复率。而源文件查重则是指使用专门的查重软件对文档的原始文件进行查重，不依赖于知网等平台。源文件查重更注重原始性和全面性，适用于各类文档的查重需求。总的来说，知网查重更侧重于学术文献的查重，而源文件查重更适用于各类文档的查重工作。

在选择查重工具时，需要根据具体的需求和文档类型来决定使用知网查重还是源文件查重。如果是学术领域的文献查重，且文献较为规范，可以考虑使用知网查重服务，方便快捷。如果是对各类文档进行查重，尤其是对于非学术文档或原始文件的查重需求较多，建议选择专业的源文件查重软件，确保查重结果的准确性和全面性。综上所述，根据具体情况选择合适的查重工具，才能更好地完成查重工作。